学校始建于1902年，前身为“江宁府上元县高等小学”，历经多次更名和整合，有着百年悠久办学历史，蕴含着深厚的历史底蕴。
从四十年代正始中学的“格物致志、诚意、正心、修身、齐家、治国、平天下”，到五十年代的“诚朴、友爱、勤学、向上”，再到八十年代“五有一和谐”的办学蓝图和九十年代的“教学生学会做人，教学生学会学习”，学校贯穿着一条“治学做人”的办学理念。
行知馆是学校的中心地标和文化根源所在。1947年，由陶行知先生的挚友姚文采为纪念陶行知逝世一周年而改名。馆内展示了学校发展的沿革以及陶行知的生平与思想发展，是学生进校后必须参观的地方。
学校以行知馆为依托，将陶行知先生的教育思想深度融入德育工作，构建出独具特色的“行—知—行”育人体系，开展爱国主义教育，完善青少年道德品质和理想人格培养。
学校开设了“陶子讲解员的养成之路”“画说陶行知”“如果文物会说话”“守护行知馆”“行知戏剧”等10多门“走近陶行知”系列课程，将大爱大德大情怀教育内容细化落实到课程教学目标中，融入教育教学全过程。
学校定期在行知广场开展“爱满学陶路”系列活动，如“老校长故事我来讲”“老校长故事我来演”等；班级还会召开“我能为祖国做什么”“学学老校长”等主题班会，培养学生的担当精神和自强精神。
学校创新方式方法，开展各种主题明确、内容丰富、形式多样、吸引力强的教育活动，如“爱心”系列活动、戏剧节活动、小先生讲堂等，以激发学生的创造力，促使学生养成良好的思想品德和行为习惯。
现有高级教师107名，特级教师、市、区学科带头人14人，市优秀青年14人，师资雄厚，教学严谨。